Podstawy modelowania molekularnego
Dwudniowy kurs z podstaw modelowania molekularnego pozwoli uczestnikom zdobyć wszechstronne zrozumienie symulacji dynamiki molekularnej oraz technik dokowania molekularnego. Uczestnik zdobędzie niezbędną wiedzę i umiejętności do przeprowadzania podstawowych symulacji MD, analizowania trajektorii oraz przeprowadzania studiów dokowania molekularnego w praktycznych zastosowaniach.
Kurs został zaprojektowany w celu dostarczenia podstawowej wiedzy i umiejętności w dziedzinie modelowania molekularnego, skupiając się na dwóch podstawowych technikach: symulacji dynamiki molekularnej (MD) i dokowaniu molekularnym.
Kurs prowadzony jest w języku angielskim (lub polskim – jeśli cała grupa uczestników będzie polskojęzyczna).
- Jesteś studentem lub badaczem, który wie, że modelowanie molekularne odgrywa kluczową rolę w zrozumieniu zachowania cząsteczek biologicznych i interakcji między białkami i ligandami?
- Jesteś naukowcem zajmującym się odkrywaniem leków, który wie, że dokowanie molekularne jest potężnym narzędziem używanym w odkrywaniu leków do przewidywania, w jaki sposób potencjalne cząsteczki leku wiążą się z docelowymi białkami?
- A może jesteś informatykiem, bioinformatykiem, pracujesz w branży biotechnologicznej lub farmaceutycznej lub jesteś samoukiem, który chce zbadać zastosowanie swoich umiejętności i chciałby skorzystać z nauki technik modelowania molekularnego.
- To szkolenie jest dla Ciebie!
*Cena zawiera: udział w zajęciach, materiały szkoleniowe, certyfikat uczestnictwa, catering kawowy.
Program szkolenia
Dzień 1.
Symulacja dynamiki molekularnej
Sesja poranna:
1. Wprowadzenie do Symulacji Dynamiki Molekularnej (MD).
2. Czym jest MD i jakie ma znaczenie w chemii obliczeniowej i biologii?
3. Popularne pola sił w symulacjach komputerowych i ich zastosowania.
Sesja popołudniowa:
1. Praktyczne pokazy uruchamiania prostych symulacji MD za pomocą oprogramowania Gromacs.
2. Przygotowanie plików wejściowych i parametrów systemu.
3. Solwatacja i jonizacja systemu.
4. Analiza trajektorii Analiza trajektorii MD.
Cel:
- Zrozumienie podstawowych zasad symulacji dynamiki molekularnej.
- Praktyczne doświadczenie w uruchamianiu podstawowej symulacji MD.
- Podstawowa wiedza z zakresu analizy trajektorii.
Dzień 2.
Dokowanie Molekularne
Sesja poranna:
- Wprowadzenie do Dokowania Molekularnego.
- Czym jest dokowanie molekularne i jakie ma znaczenie w odkrywaniu leków oraz interakcjach białko-ligand?
- Algorytmy dokowania i funkcje oceny.
Sesja popołudniowa:
- Praktyczne pokazy uruchamiania prostych studiów dokowania molekularnego za pomocą oprogramowania Autodock Vina.
- Przygotowanie receptora i ligandu do badań dokowania.
- Wizualizacja i analiza wyników dokowania.
- Dyskusja na temat zastosowań w odkrywaniu leków i interakcjach białko-ligand.
Cel:
- Zrozumienie zasad i technik dokowania molekularnego.
- Praktyczne doświadczenie w uruchamianiu symulacji dokowania.
- Wiedza z zakresu analizy i doskonalenia wyników dokowania.
- Praktyczne zrozumienie zastosowań dokowania molekularnego.
- Uczestnicy po ukończonym kursie otrzymują certyfikat.
- Razem raźniej - otrzymaj 10% zniżki na szkolenie otwarte dla każdego kolejnego pracownika z Twojej firmy.
